学院始终坚持“校院企融合发展，医理工协同育人”的办学理念，紧密围绕临床医学需求，瞄准科技前沿，发展“面向临床”的生物医学工程，为学校临床提升战略，新医科建设和双一流建设提供重要支撑。

生物医学工程学科2016年入选“十三五”江苏省重点学科（培育）并于2021年通过江苏省教育厅验收，现为“十四五”江苏省重点学科B类，设置了先进医疗器械和装置、医用生物材料与一体化诊疗技术、医用生物组学技术、智能医学工程四个学科方向，已形成鲜明特色和优势。

学院获批“智能诊疗技术及器械”教育部工程研究中心，构建智能诊疗器械 “技术攻关-工程转化-临床应用-医学教育”完整链路；获批“健康信息与康复工程实验室”江苏高校国际合作联合实验室，加速推进在神经和认知康复领域的国际合作与交流。